La tecnica del Southern blotting (intitolata al suo inventore, E. M. Southern) è usata in laboratorio per rivelare la presenza di specifiche sequenze di DNA in una miscela complessa.

La tecnica consiste nel trasferimento su un filtro di nitrocellulosa o su altro supporto di frammenti di DNA separati per elettroforesi su agarosio e quindi denaturati.

Il filtro viene poi esposto a una sonda marcata (per esempio con un isotopo radioattivo) che consiste in una sequenza di DNA o RNA complementare a quella cercata; quest’ultima potrà così essere evidenziata per ibridazione e successiva autoradiografia.